Основное применение синтетические олигонуклеотиды находят в качестве праймеров при проведении полимеразной цепной реакции (ПЦР) и секвенировании геномов, широко используемых в медицинской диагностике (диагностике вирусных инфекций, наследственных заболеваний или предрасположенности к ним), криминалистике и научных исследованиях.
Вместе с тем на основе синтетических модифицированных олигонуклеотидов (антисмысловых олигомерных морфолино, фосфоротиоатов, пептидо-нуклеиновых кислот (PNA), малых интерферирующих РНК) разрабатывается новый класс фармпрепаратов, действие которых основано на снижении экспрессии определенных генов и предотвращении появления кодируемых ими нежелательных белков (генотерапия).
Другим направлением является поиск коротких олигонуклеотидов (аптамеров), способных специфично связываться с патогенными белками (например, ВИЧ), нейтрализуя их действие, что может привести к появлению новых методов терапии.
В настоящее время наиболее эффективным методом получения олигонуклеотидов является 4-стадийный фосфорамидитный метод синтеза на пористом стекле (CPG), который реализован в автоматических синтезаторах K&A Laborgeraete (Германия). За счет полной изоляции высокоактивных реагентов от кислорода воздуха синтезаторы K&A способны производить очень длинные олигомеры (более 250 оснований) с любыми мыслимыми модификациями в количествах от нескольких микрограмм (nMol) до сотен миллиграмм (mkMol).
Постадийный фотометрический мониторинг качества синтеза по отщепляемому тритилу для каждой колонки позволяет своевременно обнаружить и повторить ошибочную стадию, не затрагивая процессы в других колонках. Чрезвычайно малое время присоединения одного основания (3-6 минут) дает возможность в течение рабочего дня нарабатывать десятки олигонуклеотидов.
Подробнее с продукцией компании K&A Laborgeraete можно ознакомиться на сайте: www.dna-synthesizer.de
